Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc2Q8BKV1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms