Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot10Q8BH15 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms