Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc5a7Q8BGY9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc5a7Q8BGY9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a7Q8BGY9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc5a7Q8BGY9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Slc5a7Q8BGY9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Slc5a7Q8BGY9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Slc5a7Q8BGY9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a7Q8BGY9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a7Q8BGY9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a7Q8BGY9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Slc5a7Q8BGY9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a7Q8BGY9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a7Q8BGY9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a7Q8BGY9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a7Q8BGY9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a7Q8BGY9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Slc5a7Q8BGY9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a7Q8BGY9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a7Q8BGY9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a7Q8BGY9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc5a7Q8BGY9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a7Q8BGY9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a7Q8BGY9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a7Q8BGY9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc5a7Q8BGY9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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