Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

Predictions only

Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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