Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm5bQ80Y84 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Kdm5bQ80Y84 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Kdm5bQ80Y84 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kdm5bQ80Y84 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kdm5bQ80Y84 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kdm5bQ80Y84 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kdm5bQ80Y84 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Kdm5bQ80Y84 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kdm5bQ80Y84 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kdm5bQ80Y84 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kdm5bQ80Y84 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kdm5bQ80Y84 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127 ms