Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Npm2Q80W85 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms