Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc1Q80VQ1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms