Protein–RNA interactions for Protein: Q80U58

Pum2, Pumilio homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum2Q80U58 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pum2Q80U58 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms