Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms