Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
NischQ80TM9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
NischQ80TM9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms