Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpap1Q80TE0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpap1Q80TE0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpap1Q80TE0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpap1Q80TE0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpap1Q80TE0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpap1Q80TE0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Rpap1Q80TE0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rpap1Q80TE0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpap1Q80TE0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms