Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lamp3Q7TST5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms