Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tnfsf18Q7TS55 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tnfsf18Q7TS55 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Tnfsf18Q7TS55 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Tnfsf18Q7TS55 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Tnfsf18Q7TS55 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Tnfsf18Q7TS55 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tnfsf18Q7TS55 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tnfsf18Q7TS55 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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