Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nphp3Q7TNH6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms