Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms