Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpopQ6ZWS8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms