Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NinlQ6ZQ12 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NinlQ6ZQ12 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms