Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd4Q6ZPR5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms