Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms