Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms