Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM8

Slc46a1, Proton-coupled folate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a1Q6PEM8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a1Q6PEM8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms