Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtifQ6PEE2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtifQ6PEE2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtifQ6PEE2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtifQ6PEE2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtifQ6PEE2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtifQ6PEE2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtifQ6PEE2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtifQ6PEE2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtifQ6PEE2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtifQ6PEE2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtifQ6PEE2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtifQ6PEE2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms