Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms