Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg2f1Q6P3A2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frg2f1Q6P3A2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg2f1Q6P3A2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg2f1Q6P3A2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg2f1Q6P3A2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg2f1Q6P3A2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg2f1Q6P3A2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg2f1Q6P3A2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg2f1Q6P3A2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg2f1Q6P3A2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg2f1Q6P3A2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg2f1Q6P3A2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg2f1Q6P3A2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg2f1Q6P3A2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg2f1Q6P3A2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg2f1Q6P3A2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg2f1Q6P3A2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg2f1Q6P3A2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms