Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms