Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Szrd1Q6NXN1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms