Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mvb12bQ6KAU4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mvb12bQ6KAU4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mvb12bQ6KAU4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mvb12bQ6KAU4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mvb12bQ6KAU4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mvb12bQ6KAU4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mvb12bQ6KAU4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mvb12bQ6KAU4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mvb12bQ6KAU4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mvb12bQ6KAU4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mvb12bQ6KAU4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mvb12bQ6KAU4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mvb12bQ6KAU4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mvb12bQ6KAU4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mvb12bQ6KAU4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mvb12bQ6KAU4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mvb12bQ6KAU4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mvb12bQ6KAU4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms