Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms