Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms