Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms