Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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Zfp248Q640N4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Zfp248Q640N4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Zfp248Q640N4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Zfp248Q640N4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Zfp248Q640N4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Zfp248Q640N4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Zfp248Q640N4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Zfp248Q640N4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp248Q640N4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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