Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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Ccdc18Q640L5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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Ccdc18Q640L5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
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Ccdc18Q640L5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc18Q640L5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
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