Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vil1Q62468 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms