Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms