Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20809Q62458 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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