Protein–RNA interactions for Protein: Q62440

Tle1, Transducin-like enhancer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tle1Q62440 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tle1Q62440 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tle1Q62440 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tle1Q62440 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tle1Q62440 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tle1Q62440 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tle1Q62440 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tle1Q62440 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms