Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf6Q62311 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms