Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Npm1Q61937 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Npm1Q61937 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms