Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms