Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itm2aQ61500 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itm2aQ61500 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itm2aQ61500 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itm2aQ61500 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itm2aQ61500 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itm2aQ61500 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itm2aQ61500 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itm2aQ61500 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itm2aQ61500 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itm2aQ61500 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itm2aQ61500 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itm2aQ61500 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms