Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox17Q61473 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox17Q61473 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms