Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccne1Q61457 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms