Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms