Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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