Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms