Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2dQ60773 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2dQ60773 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2dQ60773 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2dQ60773 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn2dQ60773 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms