Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms