Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms