Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWK7

Rnf145, RING finger protein 145, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf145Q5SWK7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf145Q5SWK7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf145Q5SWK7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms