Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms